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DNA甲基化实验

DNA甲基化是指生物体在DNA甲基转移酶(DNA methyl-transferase,Dnmts)的催化下,以S-腺苷甲硫氨酸作为甲基供体,将胞嘧啶转变为5-甲基胞嘧啶(mC)的一种反应。DNA甲基化通常抑制基因表达,去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达,这种DNA修饰方式在不改变基因序列前提下实现对基因表达的调控。

关键词:

甲基化

胞嘧啶

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详情描述

DNA甲基化实验


一、DNA甲基化介绍

  DNA甲基化是指生物体在DNA甲基转移酶(DNA methyl-transferase,Dnmts)的催化下,以S-腺苷甲硫氨酸作为甲基供体,将胞嘧啶转变为5-甲基胞嘧啶(mC)的一种反应。DNA甲基化通常抑制基因表达,去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达,这种DNA修饰方式在不改变基因序列前提下实现对基因表达的调控。

  

二、DNA甲基化检测方法

  1、甲基化特异性的PCR(Methylation-specific PCR,MSP)

  用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物进行PCR。通过电泳检测MSP扩增产物,如果用针对处理后甲基化DNA链的引物能得到扩增片段,则说明该位点存在甲基化;反之,说明被检测的位点不存在甲基化。

  2、亚硫酸氢盐测序法(Bisulfite sequencing PCR,BSP)

  用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,则未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变。随后设计BSP引物进行PCR,在扩增过程中尿嘧啶全部转化为胸腺嘧啶,最后将PCR产物克隆至载体后进行测序,就可以判断CpG位点是否发生甲基化,这种方法称为BSP-克隆测序法。

  

三.实验结果展示

 

MSP:

1

 

 

M:2000maker:2000bp:1000bp:750bp:500bp:250bp:100bp

1:5CA-M

2: 5CA-U

3:12CA-M

4:12CA-U

5:26CA-M

6:26CA-U

 

BSP:

1

 

1

1

 

四、送样运输要求:

  动物组织:新鲜的组织量100 mg(黄豆大小),最少50 mg(绿豆大小),干冰运输。

  细胞:1×10^6个细胞,收集细胞沉淀,干冰运输。

  全血:最少1 mL新鲜血液EDTA抗凝管,-20度运输。

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